您好，关于您提出的“公积金的缴存基数和五险的缴存基数不一致是否合法”的问题，这是一个涉及社保和公积金政策的重要问题，我会为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，公积金的缴存基数和五险（即社保）的缴存基数在理论上是可以不一致的，但这并不意味着企业可以随意设置不同的基数。实际上，这种不一致性主要源于两者在计算方法和规定上的差异。

对于社保缴费基数，它通常是按照职工上一年度月平均工资（或个人上月工资）来确定，同时受到当地社平工资的一定比例限制，即上下限。具体来说，社保缴费基数的上限一般是当地社平工资的300%，下限则是60%。这样的设置旨在保障职工的社保权益，同时避免企业过高或过低地缴纳社保费用。

而对于公积金缴存基数，其计算方法和规定与社保有所不同。公积金缴存基数的上限通常是按照职工月社平工资的3倍来设定，而缴存比例则在5%-12%之间浮动。此外，公积金缴费基数的下限与最低工资、最低生活保障费等相关，大部分地区以最低工资为缴存下限的基准。

由于社保和公积金在缴费基数计算方法和规定上的差异，企业在实际操作中可能会选择调整缴费基数以控制人力成本。然而，这并不意味着企业可以随意设置不同的基数。从长远发展和合规管理的角度来看，社保和公积金的基数应当尽可能规范一致，以保障职工的合法权益。

如果企业故意设置不同的缴费基数以降低成本，可能会面临一定的法律风险。例如，如果社保缴费基数低于职工实际工资水平，可能违反了《关于规范社会保险缴费基数有关问题的通知》等规定，职工有权要求企业进行补缴，并可能因此获得经济补偿。

因此，虽然公积金的缴存基数和五险的缴存基数在理论上可以不一致，但企业应当遵循相关法律法规和政策规定，合理设置缴费基数，以保障职工的合法权益和企业的合规经营。如果您发现企业存在违规行为，建议及时向相关部门投诉或寻求法律援助。