首先，对方欠你几十万，并不能直接将一百多万的店铺抵押给你，因为这涉及到债权与抵押权的法律关系，需要遵循相关的法律规定。
分析说明：
债权与抵押权的关系：
- 债权是你对对方拥有的金钱请求权，即对方欠你的钱。
- 抵押权是为了担保债权的实现，在债务人或第三人的财产上设定的权利。当债务人不履行债务时，抵押权人有权就该财产优先受偿。
抵押的设定：
- 抵押的设定需要双方达成合意，并签订书面的抵押合同。
- 抵押合同应明确抵押的财产、担保的债权种类和数额、债务人履行债务的期限、抵押权实现的方式等条款。
抵押财产的价值：
- 抵押财产的价值应与担保的债权数额相适应。在你所述的情况中，对方欠你几十万，但店铺价值一百多万，从价值上看并不对等。
- 如果双方同意，且不存在其他法律障碍，理论上可以通过协商达成抵押协议，但可能需要考虑其他因素，如店铺的评估价值、是否存在其他抵押或权利负担等。
法律程序：
- 抵押权的设立通常需要办理登记手续，以确保抵押权的对抗性和优先性。
- 如果未办理登记手续，抵押权可能无法对抗善意第三人。
法律建议：
- 协商处理：首先，你可以与对方协商，看是否能通过其他方式解决债务问题，如分期付款、以物抵债等。
- 签订抵押合同：如果双方同意以店铺作为抵押，应签订书面的抵押合同，并明确相关条款。
- 办理登记手续：如果决定设立抵押权，应尽快办理相关登记手续，以确保抵押权的合法性和有效性。
- 法律咨询：在处理此类问题时，建议咨询专业律师，以确保你的权益得到充分保护。
结论补充说明：
- 需要注意的是，即使签订了抵押合同并办理了登记手续，如果后续对方无法偿还债务且店铺价值不足以覆盖全部债权，你可能仍然面临无法完全实现债权的风险。
- 因此，在处理此类债务问题时，应谨慎考虑并寻求专业法律建议。