针对你提出的“同一个老板，两个公司，总公司的合同，分公司上班，仲裁怎么打”的问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确几个核心点：

1. 合同关系：你与总公司签订了劳动合同，但实际在分公司工作。
2. 仲裁对象：在劳动仲裁中，通常是以与你存在劳动关系的公司为仲裁对象。
3. 法律责任：总公司与分公司之间的法律责任可能因具体情况而异，需具体分析。

接下来，我给出具体的分析和建议：

1. 确定仲裁主体：

   • 由于你与总公司签订了劳动合同，原则上总公司应是你的仲裁主体。
   • 但如果分公司具有独立的法人资格，并且你的工资、社保等均由分公司实际支付，那么分公司也可能成为仲裁的共同被申请人或单独被申请人。

2. 准备仲裁材料：

   • 劳动合同：这是证明你与总公司或分公司存在劳动关系的关键证据。
   • 工作证明：如工牌、工作服、工作记录等，证明你实际在分公司工作。
   • 薪资证明：工资条、银行流水等，证明你的薪资情况。
   • 其他证据：如加班记录、请假记录、公司规章制度等，根据具体仲裁请求准备。

3. 明确仲裁请求：

   • 根据你的具体情况，明确你的仲裁请求，如要求支付工资、加班费、经济补偿金等。
   • 如果涉及分公司，可能需要同时向总公司与分公司提出仲裁请求。

4. 提交仲裁申请：

   • 向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并按照要求填写仲裁申请书。
   • 附上所有准备好的仲裁材料。

5. 参与仲裁程序：

   • 等待仲裁委员会的受理通知，并按照通知要求参与仲裁程序。
   • 在仲裁过程中，充分陈述你的事实和理由，提供充分的证据支持你的主张。

6. 注意法律风险：

   • 在仲裁过程中，注意保留所有证据原件，以防丢失或损毁。
   • 注意仲裁时效，确保在法定期限内提出仲裁申请。
   • 如果对仲裁结果不满，可以考虑向法院提起诉讼。

综上所述，针对你的具体情况，你需要首先确定仲裁主体，然后准备充分的仲裁材料，明确仲裁请求，并提交仲裁申请。在仲裁过程中，要充分陈述你的事实和理由，并提供证据支持。同时，也要注意法律风险和仲裁时效。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。