针对您提出的“自来水厂职工犯交通肇事罪是否会被开除工作以及怎么处理”的问题，以下是我的详细解答：

首先，关于是否会被开除工作：

1. 依据单位规章制度：职工是否因犯交通肇事罪而被开除，首先需参考所在自来水厂的内部规章制度。若规章制度中明确规定此类犯罪行为属于严重违反单位纪律，可导致开除，则单位有权依据此规定进行处理。
2. 考虑犯罪情节与影响：即便规章制度中未明确规定，单位在决定是否开除职工时，也会综合考虑犯罪的情节、对单位的影响以及职工的个人表现等因素。若犯罪情节严重，对单位声誉或运营造成较大影响，单位可能会倾向于开除处理。

其次，关于怎么处理：

1. 了解单位规定：建议职工首先详细查阅自来水厂的内部规章制度，了解关于职工犯罪后的处理规定。
2. 与单位沟通：在了解规定后，职工应主动与单位的人事部门或相关领导进行沟通，说明情况，表达自己的态度和认识。
3. 寻求法律帮助：如果单位决定开除职工，且职工认为该决定不合法或不合理，可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的权益。例如，可以咨询我这样的专业律师，评估单位开除决定的合法性，并探讨可能的法律救济途径。
4. 接受处理并改正：如果单位开除决定合法且合理，职工应接受处理，并深刻反省自己的错误，努力改正，以便在未来重新获得就业机会。

综上所述，自来水厂职工犯交通肇事罪是否会被开除工作，需根据单位规章制度和犯罪情节综合考虑。在处理此事时，职工应了解单位规定、与单位沟通、寻求法律帮助，并接受处理并改正。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。