在建设工程合同纠纷中，关于承包联合体另外两方是否能单独签字的问题，这主要取决于联合体的具体组成形式以及各方在联合体协议中的权利和义务约定。

首先，我们需要明确承包联合体的性质。承包联合体通常是由两个或两个以上的法人或其他组织组成，共同承包一个工程项目，并共同对工程项目的实施承担责任。联合体各方之间会签订联合体协议，明确各自的权利、义务和责任。

1. 如果联合体协议中明确规定了各方可以单独签字的情况：

   • 在这种情况下，联合体中的另外两方是有权单独签字的，但他们的签字行为应当符合联合体协议中的相关约定，且不得损害其他联合体的合法权益。

2. 如果联合体协议中未明确规定或禁止单独签字：

   • 这时需要结合具体的工程项目和合同内容来判断。一般来说，如果合同内容涉及到联合体的共同权利和义务，那么联合体各方应当共同签字，以确保合同的合法性和有效性。但如果合同内容仅涉及到联合体中的某一方或某几方的权利和义务，且不影响其他联合体的权益，那么相关方是可以单独签字的。

3. 特殊情况下：

   • 在某些特殊情况下，如联合体中的一方因故无法参与签字，而其他方需要紧急处理合同事宜时，可能会涉及到单独签字的问题。这时应当尽快与其他联合体成员沟通并取得其书面同意，或者在事后得到其追认，以确保签字行为的合法性和有效性。

综上所述，承包联合体另外两方是否能单独签字，需要根据联合体协议的具体内容以及合同的具体情况来判断。如果联合体协议或合同中有明确规定，应当按照相关规定执行；如果没有明确规定或存在特殊情况，应当及时与其他联合体成员沟通并协商处理。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。