可以起诉包工头。下面我为你详细分析一下这个问题：

首先，从法律关系上来看，房主与包工头之间通常存在建设工程施工合同关系，而包工头与工人之间则存在劳务合同关系。在正常情况下，工人报酬应由包工头支付，因为这是包工头作为雇主应尽的义务。然而，在实际操作中，有时会出现房主代包工头垫付工人报酬的情况。

当房主垫付了本应由包工头支付的工人报酬后，房主与包工头之间就形成了一个新的债权债务关系。房主作为债权人，有权要求包工头偿还这笔垫付款。如果包工头拒绝偿还，房主可以通过法律途径来维护自己的合法权益。

具体来说，房主可以向法院提起民事诉讼，要求包工头返还垫付的工人报酬。在诉讼过程中，房主需要提供相关证据来证明自己的主张，比如垫付报酬的凭证、与包工头的聊天记录或协议等。如果法院认为房主的证据充分且有力，就会支持房主的诉讼请求，判决包工头返还垫付的报酬。

此外，我还想提醒你一点，为了避免类似纠纷的发生，建议在签订建设工程施工合同时，就明确约定工人报酬的支付方式和责任主体。这样一旦出现纠纷，就能更清晰地界定双方的权利和义务，有利于问题的解决。

总之，农村建房房主代包工头垫付工人报酬后，是有权起诉包工头要求偿还的。如果你在这方面遇到了问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。