公司申请工伤认定，外包公司是否需要赔偿，需根据具体情况判断。

1. 若外包工与外包公司存在劳动关系：

   • 外包公司应承担赔偿责任。依据《工伤保险条例》，用人单位需为职工缴纳工伤保险。发生工伤后，应先申请工伤认定，认定为工伤的，可从工伤保险基金获得赔偿。
   • 若外包公司未缴纳工伤保险，其需按照工伤保险待遇项目和标准支付费用。

2. 若外包工受雇于其他主体：

   • 要分析实际用工情况。若发包公司存在将业务发包给不具备用工主体资格的组织或自然人的情况，发包公司可能需承担工伤保险责任。
   • 例如，建筑施工企业将工程发包给无资质的包工头，包工头招用的外包工发生工伤，建筑施工企业要负责。

3. 若外包工自身存在故意犯罪、醉酒或者吸毒、自残或者自杀等情形：

   • 则无法认定为工伤，公司无需赔偿。

综上所述，公司申请工伤认定时，外包公司是否需要赔偿取决于外包工与外包公司或发包公司之间的具体关系以及工伤的具体情况。如有进一步疑问或需要详细法律咨询，请直接向我提问。