个人申请工伤认定后，赔偿责任主要由用人单位承担，工伤保险基金起补充作用。具体来说：
若用人单位已依法缴纳工伤保险：
- 大部分赔偿项目，如治疗工伤的医疗费用、住院伙食补助费、交通食宿费、辅助器具安装费，以及经鉴定后的护理费、一次性伤残补助金等，由工伤保险基金支付。
- 用人单位则需支付停工留薪期间的工资、部分伤残津贴等特定费用。
若用人单位未依法缴纳工伤保险：
- 所有工伤赔偿费用，包括本应由工伤保险基金支付的项目，全部由用人单位承担。
- 若用人单位拒不支付，工伤保险基金可能会先行支付，但随后会向用人单位追偿。
在申请工伤认定和赔偿过程中，若遇到单位拒赔或协商不成的情况，您可以按照以下步骤处理：
- 首先，确认工伤认定结果已生效，并完成劳动能力鉴定，确定伤残等级。
- 与单位再次协商赔偿事宜，明确告知其依法应承担的赔偿责任。
- 若协商无果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，提交相关证据材料。
- 仲裁委受理后会进行审理并作出裁决。若单位对仲裁结果仍不执行，可向人民法院申请强制执行。
在整个过程中，我会为您提供专业的法律支持和指导。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。