员工通过出差高开住宿发票进行报销，这一行为是否违法，主要取决于行为的具体情况和后果。以下是对此问题的详细分析：
一、行为性质分析
虚假报销与职务侵占：
- 如果员工实际住宿费用低于报销金额，但故意高开发票进行报销，以非法占有为目的，将差额部分据为己有，这种行为就构成了虚假报销。
- 当虚假报销的金额达到一定数额时（如3万元以上），就可能构成职务侵占罪。对于非国家工作人员，这会受到刑法的制裁；对于国家工作人员，则可能构成贪污罪。
违反单位规章制度：
- 即使没有达到刑事犯罪的程度，高开住宿发票报销也违反了单位的财务管理制度和报销规定，单位有权根据内部规章制度对员工进行纪律处分。
税收违法行为：
- 高开发票还属于虚开发票的行为，违反了《中华人民共和国发票管理办法》。税务机关查实后，相关单位或个人可能面临罚款、吊销发票领购簿或收缴发票等行政处罚。
二、合规建议
为了避免类似问题的发生，以下是一些合规建议：
加强员工教育：
- 单位应定期对员工进行财务管理和法律知识培训，提高员工的合规意识和法律意识。
- 让员工充分了解高开住宿发票报销的法律风险和严重后果，增强自律意识。
完善报销制度：
- 单位应建立完善的报销制度和流程，明确报销标准和要求。
- 要求员工在报销时提供真实、合法的发票和凭证，并对报销费用进行严格的审核和把关。
加强内部审计：
- 单位应定期对报销费用进行内部审计和核查，确保报销费用的真实性和合法性。
- 如发现虚假报销等违规行为，应及时进行处理和纠正。
建立举报机制：
- 单位应设立举报渠道，鼓励员工积极举报高开住宿发票等违规行为。
- 对举报人给予保护和支持，确保举报信息的保密性和安全性。
综上所述，员工通过出差高开住宿发票进行报销是违法的，不仅可能面临纪律处分、行政处罚或刑事责任，还会损害个人和单位的声誉。因此，员工应严格遵守相关法律法规和单位规章制度，确保发票的真实性和合法性。同时，单位也应加强内部管理和法律培训，防止类似问题的发生。