当员工因交通事故受伤并被认定为工伤时，即使已经获得交通事故赔付的误工费，公司仍然需要支付其停工留薪期间的工伤工资。以下是对此结论的详细解释：

1. 性质与法律依据：

   • 交通事故赔偿与工伤赔偿是基于不同的法律关系。交通事故赔偿属于侵权责任范畴，是对受害人因交通事故所遭受损失的补偿，包括误工费，旨在弥补受害人因无法正常工作导致的收入减少。其法律依据主要见于《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》等相关规定。
   • 工伤赔偿则属于劳动关系范畴，是职工因工作原因受到事故伤害后依法享受的工伤保险待遇。其中，停工留薪期工资是用人单位对工伤职工在停工治疗期间应享受的工资福利待遇的保障，其法律依据主要见于《工伤保险条例》第三十三条。

2. 赔偿的独立性：

   • 误工费和停工留薪期工资在性质和功能上不同，不存在重复赔偿问题。前者是对交通事故导致的收入损失的赔偿，后者是用人单位对工伤职工的工资福利保障。
   • 根据相关法律规定，职工可以同时获得交通事故侵权赔偿和工伤赔偿。这两者在法律上并不冲突，也不能相互替代。

3. 具体实践：

   • 在大多数情况下，职工可以同时获得交通事故赔付的误工费和工伤停工留薪期工资。例如，职工在上班途中发生交通事故并认定为工伤，对方负主要责任。该职工在获得交通事故责任方赔付的误工费后，公司仍应按原工资福利待遇标准支付其停工留薪期工资。
   • 少数地区可能采取补充模式，即若职工已从交通事故侵权方获得误工费赔偿，且该金额高于或等于职工本人工资标准，用人单位可能不再支付或补足差额部分的停工留薪期工资。但这种情况需根据当地具体法律法规确定。

综上所述，交通事故赔付的误工费与工伤工资的支付是两个独立的法律体系下的赔偿项目。员工因交通事故获得的误工费赔偿，不影响其同时享受工伤保险待遇的权利。因此，公司仍需按照工伤保险的规定，支付员工在停工留薪期间的工伤工资。这是法律赋予员工的合法权益，也是公司应当履行的法定义务。