农民工工资保函并不一定是由总包单位开具的，这主要取决于具体的项目情况、合同约定以及相关法律法规的规定。下面我从几个方面来详细解释这个问题：

1. 项目情况与合同约定：

   • 在某些工程项目中，总包单位可能会作为工程项目的主体，负责整个项目的施工和管理。在这种情况下，如果合同中有明确约定，总包单位确实需要开具农民工工资保函，以确保农民工工资的按时支付。
   • 然而，并不是所有项目都会要求总包单位开具保函。有些项目可能由多个分包单位共同承担，或者农民工直接受雇于分包单位。在这种情况下，农民工工资保函可能会由分包单位或者雇主单位开具。

2. 法律法规的规定：

   • 根据我国相关法律法规，如《保障农民工工资支付条例》等，确实强调了要保障农民工的工资权益，并规定了一些措施来预防和解决拖欠农民工工资的问题。
   • 但是，具体是否要求总包单位开具农民工工资保函，以及保函的具体形式和内容，可能因地区、行业以及项目类型的不同而有所差异。因此，在实际操作中，需要参照当地的法律法规和具体政策来确定。

3. 实际操作中的灵活性：

   • 在实际操作中，农民工工资保函的开具单位可能会根据项目的实际情况和各方协商的结果来确定。有时候，为了保障农民工的权益，可能会要求总包单位或者分包单位共同开具保函，或者由其他有支付能力的单位提供担保。

综上所述，农民工工资保函并不一定是由总包单位开具的。具体由哪个单位开具，需要根据项目的实际情况、合同约定以及相关法律法规的规定来确定。如果您在这方面有具体的法律问题或者疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况给出更详细的解答。