农民工工资保函通常是开给当地的人力资源和社会保障部门或其指定的住房城乡建设主管部门的。具体提交单位应依据当地政府官方网站或项目主管部门的告知进行确认。

详细解释如下：

1. 缴纳与监管单位：

   • 施工总承包单位是农民工工资保证金的主要缴纳单位，需在银行设立专用账户并按工程施工合同额的一定比例存储保证金。
   • 社会保障部门负责农民工工资保证金的总体监管，确保资金用于保障农民工工资的支付。在具体操作上，可能是劳动监察大队等科室具体管理和审核农民工工资保证金保函。

2. 保函的具体提交单位：

   • 一般情况下，农民工工资保证金保函应提交给当地的人力资源和社会保障部门。
   • 在建设工程领域，住房和城乡建设部门或其下属的建设工程管理机构也可能参与保函的监管，特别是涉及大量农民工就业的项目。

3. 地区差异：

   • 不同地区对于农民工工资保证金保函的提交单位可能有具体规定。例如，某些城市可能由市人社局全面负责管理。
   • 因此，建议缴存单位通过访问当地政府的官方网站或咨询项目的主管部门，了解具体的提交单位和流程。

4. 保函的性质与要求：

   • 农民工工资支付保函必须采用具有见索即付性质的独立保函，且生效后不可撤销。
   • 缴存单位在提交保函前，应仔细了解并遵循当地关于农民工工资保证金的具体操作流程和要求。

综上所述，农民工工资保函的提交单位需根据当地的具体规定和操作流程来确定。如有进一步疑问或需要了解更详细的信息，请直接向我咨询。