确认劳动关系的案件可以出具调解书，但在司法实践中存在争议。以下是对此问题的详细分析：

1. 可以出具调解书的情况：

   • 在劳动争议处理中，当事人可以自行和解，也可以在调解组织、仲裁庭或法院主持下进行调解。
   • 如果在调解组织调解下就确认劳动关系达成一致，会制作调解协议书。
   • 在仲裁阶段，仲裁庭在裁决前会先行调解，如果达成协议，则制作调解书，签收后即生效。
   • 在诉讼阶段，法院也会按照自愿、合法的原则进行调解，如果达成协议，同样会制作调解书，签收后与判决书具有同等法律效力。

2. 司法实践中的争议：

   • 有观点认为，确认劳动关系纠纷原则上不能调解。因为劳动关系是劳动者和用人单位权利与义务的基础，涉及确认劳动关系的纠纷对于双方的权利、义务并不明确。有时当事人可能会利用调解掩盖非法目的，比如虚构劳动关系以缴纳保险或享受待遇等。
   • 另一观点认为，确认劳动关系案件属于身份关系确认案件，根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第一百四十三条的规定，涉及身份关系的案件不得调解。

3. 法律依据：

   • 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》（2022修正）第一百四十三条确实规定了涉及身份关系的案件不得调解。
   • 然而，在劳动争议处理的实际操作中，仍存在出具调解书的情况，这取决于具体的调解组织、仲裁庭或法院的判断和做法。

综上所述，确认劳动关系的案件在理论上可以出具调解书，但在司法实践中存在争议。具体能否出具调解书，还需根据具体的案件情况、调解组织、仲裁庭或法院的判断来确定。如果您有此类问题，建议直接咨询当地的劳动争议调解组织、仲裁庭或法院以获取准确的答复。