关于“就工资和补偿金签订协议后诉讼时效”的问题，我们可以从以下几个角度进行分析：

结论前置

就工资和补偿金签订协议后，如果双方发生争议，诉讼时效的适用主要依据相关法律法规对于劳动争议时效的规定。一般来说，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。但如果协议中另有约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则按协议约定执行。

详细分析

1. 一般规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
   • 如果劳动关系终止，那么应当自劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请。

2. 协议约定的效力：

   • 如果双方就工资和补偿金签订了协议，并且该协议中明确约定了诉讼时效或争议解决方式，那么这些约定在符合法律规定的前提下，是具有法律效力的。
   • 如果协议中约定的诉讼时效长于一年，且不违反法律法规的强制性规定，那么应当按协议约定的时效执行。
   • 如果协议中约定的诉讼时效短于一年，或者违反了法律法规的强制性规定，那么该约定可能无效，仍应适用一般规定的一年时效。

3. 特殊情况：

   • 如果因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
   • 如果当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断的，仲裁时效从中断时起重新计算。

4. 法律建议：

   • 在签订工资和补偿金协议时，建议双方明确约定诉讼时效和争议解决方式，以避免后续争议。
   • 如果发生争议，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并在规定的时效期间内申请仲裁或提起诉讼。

综上所述，就工资和补偿金签订协议后的诉讼时效问题，应首先依据相关法律法规的一般规定。同时，如果协议中有特别约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则应按协议约定执行。在发生争议时，建议及时咨询专业律师并采取相应的法律行动。