当员工因故去世但不能被认定为工亡时，单位的赔偿责任主要依据相关法律法规及实际情况来确定。以下是对此问题的详细解答：
一、单位应承担的赔偿责任
丧葬补助金：
- 单位通常需要按照统筹地区上年度职工月平均工资的6个月来支付丧葬补助金。这一标准旨在帮助家属处理丧葬事宜，减轻经济负担。
一次性救助金或抚恤金：
- 对于不能认定为工亡的情况，单位可能还需要支付一次性救助金或抚恤金给死者的直系亲属。这部分金额可能根据死者生前的薪酬标准或其他相关因素来核定，具体数额需与家属协商或由相关部门裁定。
受赡养直系亲属的救助金：
- 若死者有受赡养的直系亲属，单位可能还需按照一定标准支付救助金，以确保这些家属的基本生活需求得到满足。
二、赔偿协商与法律途径
协商赔偿：
- 单位应主动与死者家属进行沟通，协商赔偿事宜。双方应基于公平、合理的原则，共同确定赔偿金额和支付方式。
法律途径：
- 若协商不成，死者家属可以通过法律途径来维护自己的合法权益。他们可以向当地的社会保险行政部门或劳动争议仲裁委员会申请调解或仲裁，也可以直接向人民法院提起诉讼。
三、注意事项
工伤鉴定申请：
- 若雇主未能依法提出工伤鉴定申请，员工及其近亲家属或所在工会组织有权在事故发生之日或被确诊患有职业病之日起的一年之内，直接向用人单位所在地的社会保险行政部门提交工伤鉴定申请。这是确保员工权益的重要步骤。
了解相关法律法规：
- 在处理此类问题时，建议双方都深入了解相关的法律法规和政策规定，以确保自己的权益得到妥善保障。
保留证据：
- 无论是单位还是家属，在处理赔偿事宜时都应保留好相关证据和资料，以便在需要时提供证明。
综上所述，当员工因故去世但不能被认定为工亡时，单位应根据相关法律法规和实际情况承担相应的赔偿责任。双方应通过协商或法律途径来解决问题，并确保死者家属的合法权益得到妥善保障。