个体工商户妻子作为丈夫员工，一般不能向丈夫申请仲裁补交社保，但可以向当地社会保险行政部门投诉或寻求法律途径解决。以下是对此问题的详细分析：

1. 家庭关系与劳动关系的交织：

   • 在个体工商户中，妻子作为丈夫的员工，其劳动关系与家庭关系相互交织。然而，在法律上，劳动关系应当独立于家庭关系进行处理。

2. 社保缴纳的责任：

   • 作为雇主，无论是丈夫还是其他任何身份，都有义务为员工缴纳社保。这是法律规定的强制义务，不因家庭关系而免除。

3. 仲裁申请的适用性：

   • 仲裁通常适用于解决劳动争议，但在这个特定情境下，妻子作为丈夫的员工，其仲裁申请可能会受到家庭关系的影响，导致仲裁机构在受理时存在顾虑。
   • 此外，仲裁机构主要处理的是基于劳动合同关系的争议，而家庭内部的社保缴纳问题可能更多地涉及行政监管和法律责任。

4. 正确的解决途径：

   • 妻子可以向当地社会保险行政部门投诉，要求丈夫作为雇主履行社保缴纳义务。
   • 如果丈夫拒不履行，妻子还可以考虑通过法律途径追究其法律责任，包括但不限于提起诉讼。

5. 法律咨询的必要性：

   • 鉴于家庭关系与劳动关系的复杂性，以及社保缴纳问题的法律性质，妻子在采取任何行动之前，最好咨询专业律师的意见。
   • 律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议，帮助妻子选择最合适的解决途径。

综上所述，个体工商户妻子作为丈夫员工，在社保缴纳问题上应当明确其法律地位和责任。虽然一般不能直接向丈夫申请仲裁补交社保，但可以通过向社会保险行政部门投诉或寻求法律途径来维护自己的合法权益。