当公司接到法院要求协助执行员工工资的通知时，应当严格按照法律程序和要求进行操作，以避免可能的法律责任。以下是一些具体的建议和步骤：

首先，公司需要仔细审查法院送达的协助执行通知书，确保对其内容有清晰的理解。通知书通常会明确说明需要协助执行的具体事项，如扣留被执行人的部分或全部工资，以及扣留的期限和金额等。

其次，公司应当立即按照协助执行通知书的要求执行。这意味着，在未经法院同意的情况下，公司不得擅自将应扣留的工资发放给被执行人。如果公司违反了这一要求，可能会面临法律责任，包括被罚款、拘留等惩戒措施，甚至可能依法追究刑事责任。

在执行过程中，公司需要保持与法院的沟通渠道畅通。如果公司在执行过程中遇到任何问题或困难，或者对协助执行通知书的内容有任何疑问，应当及时与法院联系并寻求指导。

此外，公司还需要注意保护被执行人的合法权益。虽然公司需要按照法院的要求协助执行，但也应当尊重被执行人的基本生活需求。例如，根据法律规定，法院在扣留工资时通常会为被执行人保留一定的生活必需费用。公司在执行时应当注意这一点，并确保不侵犯被执行人的合法权益。

最后，如果公司因故未能按照协助执行通知书的要求执行，或者因执行不当导致财产损失等后果，应当及时与法院协商并寻求解决方案。在必要时，公司可能需要承担相应的赔偿责任。

总之，当公司接到法院要求协助执行员工工资的通知时，应当认真对待并严格按照法律程序和要求进行操作。通过仔细审查通知书、立即执行、保持与法院的沟通、保护被执行人的合法权益以及及时寻求解决方案等措施，公司可以有效地履行协助执行义务并避免可能的法律责任。