当挂靠别人公司的包工头死了，他欠的民工工资该由谁来支付，这个问题需要根据具体情况来确定责任主体。以下是几种可能的情况及对应的责任主体：

1. 包工头有资质且属于承包单位：

   • 如果包工头具备相关资质并且属于承包单位，那么农民工可以向其承包的单位索要工资。因为承包单位对农民工的工资支付负有直接责任，需承担起支付工资的义务。

2. 包工头无资质且挂靠其他单位：

   • 当包工头没有资质，而是挂靠在其他单位承包工程时，农民工可以向被挂靠单位主张工资。此时，被挂靠单位要承担连带支付责任，不能推诿。这意味着，即使包工头死亡，被挂靠单位仍然需要支付农民工的工资。

3. 多个主体参与工程：

   • 如果工程涉及多个主体，如总承包单位、分包单位等，农民工既可以向直接雇佣自己的主体主张工资，也可以向其他相关主体提出诉求。各主体需按照相应规定承担责任，确保农民工的工资得到支付。

4. 包工头死亡有遗产：

   • 若包工头死亡且留有遗产，那么可以从其遗产中支付农民工工资。这种情况下，农民工需要通过法律途径来追讨工资，并确保自己的权益得到保障。

综上所述，当挂靠别人公司的包工头死了且欠下民工工资时，农民工应根据具体情况向相关责任主体主张权利。如果无法确定责任主体或遇到支付困难，建议农民工及时咨询当地劳动监察部门或专业律师，以获取更具体的法律帮助和解决方案。