在包工队挂靠有证公司施工，施工中出现死亡事故的情况下，赔偿款的支付主体主要取决于挂靠关系的性质以及事故责任的具体认定，但通常情况下，被挂靠公司和包工队都可能需要承担赔偿责任。以下从几个方面进行详细分析：
一、挂靠关系的法律性质
挂靠行为在法律上通常被视为一种违法行为，因为它违反了建筑市场的准入和监管规定。被挂靠公司允许包工队以其名义进行施工，实际上是在出借自己的资质，这种行为不仅扰乱了建筑市场秩序，也可能给施工安全带来隐患。因此，一旦发生事故，被挂靠公司往往难以完全免责。
二、赔偿责任的承担
被挂靠公司的责任：
- 根据相关法律法规和司法实践，被挂靠公司作为名义上的施工单位，对施工现场的安全生产负有法定责任。即使实际施工由包工队完成，被挂靠公司也不能完全摆脱对事故的责任。
- 在事故发生后，被挂靠公司通常需要承担一定的赔偿责任，这包括但不限于支付死亡赔偿金、丧葬费、被扶养人生活费等。
包工队的责任：
- 包工队作为实际施工单位，对施工现场的安全生产负有直接责任。如果事故是由于包工队的违规操作或管理不善导致的，那么包工队应当承担主要的赔偿责任。
- 在某些情况下，包工队可能因经济能力有限而无法全额支付赔偿款，这时被挂靠公司可能需要承担补充赔偿责任。
三、赔偿款的支付方式
协商支付：
- 在事故发生后，被挂靠公司和包工队可以与死者家属进行协商，就赔偿款的金额和支付方式达成一致。这种方式相对灵活，可以更快地解决纠纷。
诉讼支付：
- 如果协商不成，死者家属可以向法院提起诉讼，要求被挂靠公司和包工队承担赔偿责任。法院将根据事故责任的具体认定和相关法律法规的规定，判决赔偿款的金额和支付方式。
四、特殊情况下的责任划分
- 如果挂靠关系被认定为无效（例如，因违反法律法规的强制性规定），那么被挂靠公司和包工队可能需要根据各自的过错程度来分担赔偿责任。
- 如果事故是由于第三方的原因导致的（例如，设备故障、自然灾害等），那么第三方也可能需要承担一定的赔偿责任。但这种情况下，被挂靠公司和包工队仍可能因未尽到安全管理义务而承担部分责任。
五、建议与提醒
- 对于被挂靠公司：应严格遵守建筑市场的准入和监管规定，不得出借资质或允许他人挂靠施工。同时，应加强对施工现场的安全管理，确保施工安全。
- 对于包工队：应具备相应的施工资质和安全生产条件，严格遵守施工规范和安全操作规程。在施工过程中，应加强对工人的安全教育和培训，提高工人的安全意识。
- 对于死者家属：在事故发生后，应及时收集相关证据（如事故现场照片、证人证言等），并与被挂靠公司和包工队进行协商或向法院提起诉讼以维护自己的合法权益。
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