合同中的标准工时改为综合工时，这确实涉及工时制度的重大变更。以下是对这一变更的详细解答：
一、标准工时制与综合工时制的定义及区别
标准工时制：
- 定义：由法律明确规定，要求各用人单位和一般职工普遍实行的基本工时制度。
- 工作时间：每日工作时间不超过8小时，每周工作时间不超过40小时，且应保证劳动者每周至少休息一日。
- 法律依据：《中华人民共和国劳动法》第三十六条及《国务院关于职工工作时间的规定》。
综合工时制：
- 定义：适用于因工作性质特殊需连续作业或受季节及自然条件限制的岗位，以一定周期（如周、月、季、年）综合计算工作时间的一种工时制度。
- 工作时间：以一定周期综合计算，平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。在周期内可以集中工作、集中休息。
- 法律依据：原劳动部《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》。
二、标准工时转综合工时的流程与注意事项
讨论与协商：
- 企业需让职工代表大会或全体职工对工时变更进行深入讨论，并与工会或职工代表进行平等、公正的协商，以达成一致意见。
审批程序：
- 变更工时制度需遵守国家关于特殊工时制度的审批规定，向当地劳动保障行政部门提交申请报告、营业执照副本及复印件、特殊工时制度方案等相关材料，并经过审批后方可实施。
公示与告知：
- 审批通过后，企业需将新的工时制度公示给每位受影响的劳动者，并确保其充分了解。
劳动者权益保障：
- 若劳动者对新的工时制度持不同意见，他们有权要求聘用方无条件地按照先前与之签署的劳动合同约定继续承担义务。
- 在综合工时制下，企业应严格按照法律规定支付加班费，确保劳动者权益不受损害。
三、违规风险与合规建议
违规风险：
- 若企业未经职工代表大会或全体职工讨论、未与工会或职工代表协商、未向劳动部门申请许可或未公示新的工时制度，则可能构成违规行为，面临法律风险。
合规建议：
- 企业在考虑将标准工时制变更为综合工时制时，应充分了解相关法律法规和政策要求，确保变更流程合规。
- 与劳动者进行充分沟通，解释工时变更的原因和必要性，争取其理解和支持。
- 严格遵守加班费的支付规定，确保劳动者权益得到妥善保障。
综上所述，将标准工时制变更为综合工时制需遵循严格的法律程序和要求。企业应确保变更流程合规、与劳动者充分沟通，并严格遵守相关法律法规和政策要求，以保障职工的合法权益和企业的稳健发展。