在二审期间，单位不可以停发被判处有期徒刑员工的工资。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
2. 《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第二十八条：劳动者涉嫌违法犯罪被有关机关收容审查、拘留或逮捕的，用人单位在劳动者被限制人身自由期间，可与其暂时停止劳动合同的履行。暂时停止履行劳动合同期间，用人单位不承担劳动合同规定的相应义务。劳动者经证明被错误限制人身自由的，暂时停止履行劳动合同期间劳动者的损失，可由其依据《国家赔偿法》要求有关部门赔偿。

二. 分析说明

1. 工资支付原则：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当按月支付给劳动者，且不得无故拖欠。这是保障劳动者合法权益的基本原则。
2. 特殊情况处理：虽然《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第二十八条提到了在劳动者被限制人身自由期间，用人单位可与其暂时停止劳动合同的履行，但这一规定并不适用于二审期间的情况。因为此时劳动者并未被最终确定有罪，且仍在履行其法律程序。
3. 二审期间的法律地位：在二审期间，一审的判决并未生效，因此劳动者在法律上仍然享有其原有的权利，包括工资支付权。单位不能仅仅因为一审判决有期徒刑就停发员工的工资。

三. 结论

综上所述，在二审期间，单位不可以停发被判处有期徒刑员工的工资。因为此时一审判决并未生效，劳动者在法律上仍然享有其工资支付权。如果单位擅自停发工资，可能会构成对劳动者合法权益的侵犯。

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