单位经营困难不发工资，并不需要直接进行备案，但应依法处理相关事宜。具体来说：

1. 明确法律责任：单位因经营困难不发工资，首先应当明确的是，这违反了《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，单位有义务按时足额支付劳动者的工资。

2. 与单位沟通：劳动者可以尝试与单位进行协商，了解经营困难的具体情况，并表达自身对于工资支付的合理诉求。通过沟通，双方可以探讨是否有可能达成延期支付、分期支付或其他解决方案。

3. 向劳动监察部门投诉：如果与单位沟通无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并督促单位支付工资。劳动监察部门有权对单位的违法行为进行调查，并采取相应的行政措施。

4. 申请劳动仲裁或提起诉讼：在劳动监察部门无法解决问题的情况下，劳动者可以依法向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼。这两种方式都是解决劳动争议的法律途径，劳动者可以根据自身情况选择合适的方式。

5. 备案并非必要步骤：需要注意的是，备案并不是处理此类问题的必要步骤。劳动者应当重点关注如何通过法律途径维护自身的合法权益，而不是过分纠结于是否需要备案。

综上所述，单位经营困难不发工资时，劳动者应当通过明确法律责任、与单位沟通、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式来维护自身的合法权益。如果你在此过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询。