当施工员违规指挥导致工人受伤时，处罚标准主要依据相关法律法规进行判定，并涉及多个方面。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据及罚款标准
《中华人民共和国安全生产法》：
- 该法规定了生产经营单位的安全生产保障义务。若施工单位存在违规操作行为，导致工人受伤，将视为未履行安全生产管理职责。
- 罚款额度根据事故情节严重程度分为：
- 一般事故：处三十万元以上一百万元以下的罚款。
- 较大事故：处一百万元以上二百万元以下的罚款。
- 重大事故：处二百万元以上一千万元以下的罚款。
- 特别重大事故：处一千万元以上二千万元以下的罚款。
《建设工程安全生产管理条例》：
- 规定了建设工程各方主体的安全生产责任。若因违规操作致使工人受伤，建设行政主管部门有权责令限期改正；逾期未改正的，将责令停业整顿，并处以1万元以上10万元以下的罚款。
二、罚款考量因素
罚款的具体金额并非固定，而是根据以下因素综合判定：
- 违规行为的性质和严重程度：如违规操作是否严重违反安全操作规程、是否为多次违规等。
- 事故造成的后果：包括工人受伤的程度（轻伤、重伤、死亡）及受伤人数等。
- 施工单位事后的态度和措施：如是否积极救援、主动报告事故、配合调查并及时整改等。
三、民事赔偿责任
除行政处罚外，施工单位还需承担民事赔偿责任，包括赔偿受伤工人的医疗费用、误工费、残疾赔偿金、精神损害抚慰金等损失。
四、工伤认定与赔偿流程
工伤认定：
- 施工单位应在事故发生后30日内向社会保障行政主管机关提交工伤认定申请。
- 社会保险行政部门在接到申请后60个工作日内作出工伤认定决定，并书面通知受伤员工或其直系亲属及单位。
赔偿流程：
- 认定为工伤的员工将享受相应的工伤福利待遇。
- 治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。
- 同时，员工也可与单位协商要求单位进行赔偿。
五、建议与总结
为避免此类事故的发生，建议施工单位：
- 严格遵守相关安全管理规定，确保施工安全。
- 建立健全安全生产管理制度，加强员工安全教育培训。
- 提高安全意识，预防事故的发生。
- 一旦发生事故，应积极配合调查，及时采取措施整改。
综上所述，施工员违规指挥导致工人受伤时，处罚标准涉及多个方面，包括法律依据、罚款考量因素、民事赔偿责任以及工伤认定与赔偿流程等。施工单位应严格遵守相关法律法规，确保施工安全，避免此类事故的发生。