公司员工离岗要去科长那里拿离岗证且离岗不能超过10分钟的规定，并不直接涉及法律的合法性判断，而是公司内部管理规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 公司内部管理规定的性质：

   • 公司有权根据自身的运营需求和管理理念，制定一系列的内部管理规定，包括员工离岗、请假、考勤等方面的制度。
   • 这些规定只要不违反国家法律法规的强制性规定，且经过合法程序制定并公示，即可在公司内部产生约束力。

2. 离岗证与离岗时间的规定：

   • 要求员工离岗时去科长那里拿离岗证，可能是公司为了加强员工离岗管理、确保工作交接顺畅而采取的一种措施。
   • 离岗时间不能超过10分钟，可能是公司根据工作岗位的性质、工作任务的紧急程度以及员工的工作效率等因素综合考虑后确定的一个合理时间范围。

3. 合法性判断：

   • 从法律角度来看，公司制定这样的规定并不直接涉及法律的合法性判断。只要该规定没有侵犯员工的合法权益（如休息休假权、劳动报酬权等），且符合劳动法律法规的相关规定，即可视为合法。
   • 如果员工认为该规定不合理或侵犯了自己的权益，可以通过与公司沟通、协商或向劳动监察部门投诉等方式来维护自己的权益。

4. 建议：

   • 对于员工来说，如果认为公司的离岗规定不合理或难以执行，可以与公司相关部门或领导进行沟通，提出自己的意见和建议。
   • 公司在制定内部管理规定时，也应充分考虑员工的意见和建议，确保规定的合理性和可操作性。

综上所述，公司员工离岗要去科长那里拿离岗证且离岗不能超过10分钟的规定，是公司内部管理规定的一部分，并不直接涉及法律的合法性判断。员工应遵守公司的规定，如有异议可通过合法途径表达。