国有企业违规发放补贴，员工应主动退还违规补贴，并配合企业内部调查，同时可举报相关违规行为。具体分析如下：

一. 员工应主动退还违规补贴

• 国有企业违规发放的补贴，员工在得知后，应主动退还。因为这部分补贴违反了国家相关法律法规和政策规定，员工继续持有可能会涉及法律责任。通过主动退还，可以表明自己的立场，避免后续可能的法律纠纷。

二. 配合企业内部调查

• 当企业内部审计部门或纪律检查部门启动调查时，员工应积极配合，提供相关信息和资料。这有助于企业快速查明事实，对违规发放补贴的行为进行严肃处理。

三. 举报相关违规行为

• 如果员工发现企业存在违规发放补贴的行为，且企业内部未进行有效处理，员工可以向相关部门进行举报。这既是维护企业合规运营的需要，也是保护国有资产不受侵害的责任体现。

四. 法律后果与责任

• 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，如果员工明知补贴是违规发放而仍然接受，且数额较大，可能会构成犯罪，需要承担刑事责任。因此，员工应充分认识到违规发放补贴的严重性，避免卷入不必要的法律风波。

我建议，作为国有企业员工，应时刻保持警惕，不参与任何违规活动。一旦发现企业存在违规发放补贴的行为，应主动退还、配合调查，并积极举报，以维护企业的合规运营和国有资产的安全。如有进一步需要，您可以继续咨询我。