结论前置：倾倒垃圾的行为中，虽然驾驶员是直接行为人，但行驶证属于公司，因此被处罚的主体通常应当是公司，而非驾驶员个人。不过，具体责任归属还需根据违法行为的性质、公司管理制度以及驾驶员与公司的关系等综合判断。

分析说明：

1. 公司责任：根据《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规，机动车的所有人或管理人应当对车辆的使用和管理负责。在此案例中，行驶证属于公司，意味着公司是该车辆的所有人或管理人。因此，当车辆发生违法行为（如倾倒垃圾）时，公司通常应当承担相应的法律责任。

2. 驾驶员责任：驾驶员作为直接行为人，虽然实施了倾倒垃圾的行为，但其行为是在履行公司职务或受公司指派的过程中发生的，且其驾驶的车辆属于公司所有。因此，在大多数情况下，驾驶员的个人责任会被公司责任所吸收，除非驾驶员存在故意或重大过失等特殊情况。

3. 综合判断：在具体案件中，还需要综合考虑多种因素来判断责任归属。例如，公司是否有明确的规章制度禁止驾驶员倾倒垃圾、驾驶员是否明知故犯、公司是否对驾驶员进行了充分的培训和管理等。这些因素都可能影响最终的责任认定。

法律建议：

• 对于公司而言，应建立健全的管理制度，明确车辆使用规定和驾驶员职责，加强对驾驶员的培训和管理，以防范类似违法行为的发生。
• 对于驾驶员而言，应严格遵守交通法规和公司规定，不得擅自使用车辆进行违法活动。如因工作需要倾倒垃圾等废弃物，应事先征得公司同意并按照相关规定进行。
• 如遇类似纠纷或处罚，建议及时咨询专业律师（如谢万扬律师），以便根据具体情况进行法律分析和应对。