针对你提出的问题，即女方在两家事业单位工作但均为合同工而非编制内员工可能存在的问题，我将从以下几个方面进行详细分析：

一、劳动合同关系

1. 合同稳定性：作为合同工，女方与事业单位之间建立的是劳动合同关系，而非人事关系。这意味着她的工作稳定性可能不如编制内员工，合同期满或特定条件下，单位有权不续签或解除劳动合同。

2. 福利待遇：合同工通常无法享受与编制内员工相同的福利待遇，如住房公积金、医疗保险、退休金等。这些差异可能因地区和单位政策而异，但普遍存在于合同工与编制内员工之间。

二、劳动权益保护

1. 劳动法适用：尽管女方是合同工，但她仍然受《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的保护。这意味着她在工作时间、休息休假、劳动报酬、劳动安全卫生等方面享有法定的权益。

2. 维权难度：与编制内员工相比，合同工在维权时可能面临更大的难度。例如，在遭遇不公平待遇或劳动争议时，合同工可能需要通过法律途径来维护自己的权益，而这一过程可能更加复杂和耗时。

三、职业发展

1. 晋升机会：在事业单位内部，编制内员工通常享有更多的晋升机会和职业发展路径。合同工可能因身份限制而难以获得同等的晋升机会。

2. 培训与发展：事业单位可能更倾向于为编制内员工提供培训和发展机会，以提升其专业技能和职业素养。合同工在这方面可能面临较少的支持。

四、建议与应对

1. 明确合同条款：女方应仔细审查与两家事业单位签订的劳动合同，确保合同条款明确、合法，并充分保护自己的权益。

2. 了解政策差异：了解并接受作为合同工与编制内员工在福利待遇、职业发展等方面的差异，做好心理预期和规划。

3. 积极维权：如遇不公平待遇或劳动争议，女方应积极通过法律途径维护自己的权益，必要时可寻求专业律师的帮助。

综上所述，女方作为两家事业单位的合同工，可能面临合同稳定性、福利待遇、劳动权益保护、职业发展等方面的挑战。因此，她应充分了解自己的权益和义务，做好职业规划，并在必要时积极维权。如有任何具体问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。