关于工程质量问题鉴定费用由谁承担的问题，这是一个涉及工程合同、法律责任及司法实践的综合问题。以下是对此问题的详细分析：

结论前置：工程质量鉴定费用的承担需根据具体情况确定，原则为“谁的责任谁出钱”，并可通过双方协商、鉴定结果、责任比例及法官裁量等方式明确。

1. 双方协商确定：

   • 在工程建设活动中，发包人与承包人可在建设工程合同中预先约定工程质量鉴定费用的承担方式。若合同中有明确条款，则按约定执行。这是双方基于自愿原则对费用承担作出的安排，具有法律效力。

2. 根据鉴定结果确定：

   • 鉴定工程质量合格：若鉴定结果表明工程质量符合标准，说明承包人已履行合同义务，发包人要求鉴定的行为属不合理。此时，鉴定费用应由发包人承担，以体现对承包人合法权益的保护。
   • 鉴定工程质量不合格：若鉴定结果显示工程质量存在问题，意味着承包人存在违约行为。此时，鉴定费用应由承包人承担，作为对其违约行为的惩罚和损失赔偿的一部分。同时，若建设单位请第三方检测并发现质量问题，检测和修复费用也应由施工单位承担。

3. 双方都有责任时按比例承担：

   • 当工程质量问题非单一方过错导致，如发包人设计缺陷与承包人施工不规范并存时，鉴定费用应按双方过错比例分担。这体现了公平原则和过错责任原则的结合，确保双方根据各自的责任大小承担相应的费用。

4. 法官根据具体情况裁量：

   • 对于复杂案件，难以简单依据上述规则确定鉴定费用承担时，法官会综合考虑双方举证情况、鉴定程序启动和配合程度等因素，依据公平原则和诚实信用原则，酌情确定承担主体和分担比例。这体现了司法裁量的灵活性和公正性。

综上所述，工程质量鉴定费用的承担是一个灵活且需根据实际情况判断的问题。双方应尽可能在合同中明确约定，以减少后续争议。在未约定或约定不明的情况下，应依据鉴定结果、责任大小及法官裁量来确定承担主体。总之，遵循“谁的责任谁出钱”的原则，确保费用承担的合理性和公平性。如有进一步疑问或需要具体法律建议，请直接向我咨询。