非法运营车辆被扣押后，车主或驾驶人员需要按照一系列步骤来取回车辆。以下是一个清晰、详细且有深度的解答流程：

一、接受处罚

1. 前往公安管理部门：驾驶人员需尽快前往当地公安交通管理部门或指定的执法机构，了解车辆被扣押的具体情况，并接受相应的行政处罚。

2. 处罚内容：处罚通常包括没收违法所得和罚款。罚款数额根据违法所得的倍数决定，一般为违法所得的2至10倍；若无违法所得，则罚款金额在3万元至10万元之间。

二、办理取车手续

1. 缴纳罚款：在接受处罚后，按照罚款通知单上的要求，及时缴纳罚款。

2. 提供必要文件：准备并携带相关证件，如身份证、驾驶证、行驶证等，以及罚款缴纳凭证，前往扣押车辆的地点办理取车手续。

3. 签署相关文件：可能需要签署车辆领取确认书或其他相关文件，以确认车辆已经归还并解除扣押。

三、行政复议或诉讼

1. 申请行政复议：如果车主对扣车决定或处罚有异议，可以在规定时间内向上一级公安机关交通管理部门或政府法制机构申请行政复议。

2. 提起行政诉讼：如果行政复议未能解决问题，车主还可以依法向人民法院提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。

四、注意事项

1. 扣押期限：根据《中华人民共和国行政强制法》，查封、扣押的期限不得超过30日；情况复杂的，经行政机关负责人批准，可以延长，但延长期限不得超过30日。车主应关注扣押期限，确保在期限内完成取车手续。

2. 车辆保管：在车辆被扣押期间，执法部门有义务妥善保管被扣车辆。如果车辆因执法部门的过错而损坏或灭失，车主有权要求执法部门承担相应的赔偿责任。

3. 合法运营：取回车辆后，车主应确保车辆合法运营，遵守相关法律法规，避免再次因非法运营而被扣押。

综上所述，非法运营车辆被扣押后，车主或驾驶人员需要前往公安管理部门接受处罚、缴纳罚款，并携带相关证件办理取车手续。如果对扣车决定或处罚有异议，可以申请行政复议或提起行政诉讼。在整个过程中，车主应关注扣押期限、车辆保管以及合法运营等问题，以确保自己的权益得到保障。