专职员工另注册个体户做生意本身并不违法。但是，这一行为是否合法还需考虑多个因素，以下是对此问题的全面分析：

1. 公司规章制度与劳动合同：

   • 首要的是，需要查看公司的规章制度以及员工与公司签订的劳动合同中是否有相关限制或禁止性规定。
   • 如果规章制度或劳动合同中明确禁止员工在外从事与公司业务相同或相似的个体户经营，那么员工此举可能构成违约，需承担相应的违约责任。

2. 竞业禁止与保密义务：

   • 对于某些特定行业或职位，如涉及商业秘密、技术秘密等，公司可能会与员工签订竞业禁止协议。
   • 在竞业禁止期限内，员工不得从事与公司业务相同或相似的经营活动，否则可能构成违约并需承担法律责任。
   • 同时，员工还需遵守保密义务，不得泄露公司的商业秘密。

3. 个体户经营的合法性：

   • 员工注册的个体户必须遵守相关法律法规，如办理工商登记、税务登记等。
   • 个体户的经营活动必须合法，不得从事违法违规的经营行为。

4. 对公司利益的影响：

   • 员工另注册个体户做生意，如果与公司业务产生冲突或竞争，可能会损害公司的利益。
   • 在这种情况下，公司有权要求员工停止个体户经营或采取其他必要措施保护公司利益。

综上所述，专职员工另注册个体户做生意本身并不违法，但具体是否合法还需根据公司的规章制度、劳动合同、竞业禁止协议以及个体户经营的合法性等多个因素进行综合判断。如果员工有此类行为，建议提前咨询公司法务或专业律师，以确保自身行为的合法性。