结论前置：在职期间另外注册公司是否违法，需根据具体情况综合判断。若未违反竞业限制、忠实义务，未侵犯商业秘密或进行职务犯罪，且符合公司章程和法律规定，则一般不构成违法；反之，则可能构成违法。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下的合法性
法律允许性：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，并未明确禁止劳动者在职期间注册公司。因此，从法律层面看，在职员工注册公司本身并不直接构成违法行为。
注册程序与条件：
- 设立公司需依法向公司登记机关申请设立登记，并符合公司法规定的设立条件，如股东人数、注册资本、公司章程等。只要满足这些条件，员工有权注册自己的公司。
无利益冲突与违约行为：
- 若员工注册的公司与所在单位业务无关联，不存在竞争关系或利益冲突，且未利用现公司资源，也未违反与现公司签订的劳动合同、保密协议、竞业限制协议等相关约定，则通常不视为违法。
二、可能构成违法的情形
违反竞业限制协议：
- 定义与后果：竞业限制协议是公司与员工之间约定的，限制员工在离职后（部分协议也可能涵盖在职期间）一定期限内从事与公司有竞争关系的业务或设立竞争性企业的协议。若员工违反竞业限制约定，注册了与现公司有竞争关系的公司，则构成违约，公司有权要求员工停止违约行为、支付违约金，并可能追究其他法律责任。
- 示例：一名在科技公司工作的员工，在职期间注册了一家与科技公司业务相似的公司，且该行为违反了与科技公司签订的竞业限制协议，则该员工的行为构成违法。
侵犯原公司商业秘密：
- 定义与后果：商业秘密是指不为公众所知悉、能为权利人带来经济利益、具有实用性并经权利人采取保密措施的技术信息和经营信息。若员工在新公司中使用了原公司的商业秘密，如客户信息、营销策略、技术资料等，则可能构成对原公司商业秘密的侵犯，需要承担民事赔偿责任，甚至可能面临刑事责任。
- 示例：一名在销售公司工作的员工，在职期间注册了一家销售公司，并利用原公司的客户信息进行业务拓展，则该员工的行为构成侵犯商业秘密。
违反公司法规定的忠实义务：
- 定义与后果：《公司法》规定，公司的董事、高级管理人员对公司负有忠实义务和勤勉义务，不得未经股东会或者股东大会同意，自营或者为他人经营与所任职公司同类的业务。若董事、高级管理人员违反忠实义务，注册与所任职公司经营同类业务的公司，则公司有权要求其将从事该同类业务所获得的收入归公司所有，并可能追究其其他法律责任。
- 示例：一名在某公司担任董事的员工，在职期间注册了一家与该公司经营同类业务的公司，且未经过股东会同意，则该员工的行为构成违反忠实义务。
特殊职业限制：
- 定义与后果：对于国家公务员、法官、检察官等特殊职业人员，法律明确规定禁止其从事营利性活动。因此，这些职业的员工不能注册自己的公司，否则将构成违法。
三、建议与注意事项
仔细审查合同与协议：
- 在决定注册公司前，员工应仔细审查自己的劳动合同、保密协议、竞业限制协议以及公司的规章制度，确保自己的行为不会构成违约或违法。
避免利益冲突：
- 新成立的公司应避免与现任职公司存在直接的业务竞争关系，以维护双方利益。若确实存在利益冲突，应提前与现公司沟通并寻求解决方案。
合理分配时间与精力：
- 员工应确保在职期间能够履行好本职工作，不影响所在单位的正常工作秩序。若因注册公司而影响本职工作，用人单位有权解除劳动合同。
合法合规经营：
- 无论是否在职，注册公司都需遵守相关法律法规，确保合法合规经营。避免利用职务之便或公司资源进行不正当竞争或违法行为。
综上所述，在职期间另外注册公司是否违法需综合考虑多种因素。员工应仔细评估自身情况，并确保行为符合法律法规和公司规定，以避免不必要的法律纠纷和损失。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。