关于工程履约保证金扣除的后果，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

1. 合同约定的合法性：

   • 如果建设工程合同中明确约定了在特定情形下可以扣除履约保证金，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么在满足约定条件时，发包方有权扣除履约保证金。
   • 如果合同中没有明确约定或者约定违反法律法规，发包方随意扣除履约保证金则可能构成违约，承包方有权要求返还并追究其违约责任。

2. 扣除数额的合理性：

   • 扣除的履约保证金数额应当与承包方违约造成的损失相当。如果扣除的数额过多，超出了实际损失，承包方可以通过法律途径要求调整。

3. 法律后果：

   • 如果发包方合法地扣除了履约保证金，那么该部分资金将不再返还给承包方，作为对承包方违约行为的惩罚和补偿。
   • 如果发包方非法扣除履约保证金，承包方不仅可以要求返还，还可以依据合同约定或法律规定追究发包方的违约责任，包括但不限于赔偿损失、支付违约金等。

4. 实际案例：

   • 在实际工程中，如果承包方未按照合同约定的质量和工期要求施工，发包方有权根据合同约定扣除履约保证金。例如，某施工方在工程建设中未按约定施工，导致工程质量不合格，发包方依据合同约定扣除了其缴纳的履约保证金。

综上所述，工程履约保证金扣除的后果取决于合同约定的合法性、扣除数额的合理性以及实际违约情况。因此，在签订建设工程合同时，双方应当明确约定履约保证金的扣除条件和数额，以避免后续产生争议。如果发生争议，建议双方首先通过友好协商解决；协商不成时，可以寻求法律途径解决。