政府采购合同如果双方协商解约，其处理流程应遵循相关法律法规，并确保过程的合法性与有效性。以下是对此问题的详细解答：

一、协商解约的前提

在政府采购合同中，如果双方希望协商解约，首先需要确认合同中是否存在预设的解除条款。如果合同中有明确约定一方或双方在特定条件下可以解除合同的条款，并且这些条件已经达成，那么双方可以根据这些条款来协商解约。

二、协商解约的流程

1. 双方沟通：首先，双方需要就解约事宜进行充分的沟通，明确解约的原因、条件以及后续的处理方式。

2. 达成一致：在沟通过程中，双方应努力寻求共识，并就解约的具体事项达成一致意见。这包括但不限于解约的时间、方式、违约金的支付（如有）、后续责任的承担等。

3. 签订解约协议：为了确保解约的合法性和有效性，双方应签订书面的解约协议。该协议应详细记录双方协商的结果，包括解约的具体条款、双方的权利和义务等。

4. 执行解约协议：解约协议签订后，双方应按照协议的内容执行。这可能包括支付违约金、退还已支付的款项、交接相关物品或资料等。

三、注意事项

1. 合法性：协商解约的过程必须遵守相关法律法规，确保解约的合法性和有效性。如果解约过程中存在违法行为，可能会导致解约无效或引发法律纠纷。

2. 书面记录：双方应保留所有与解约相关的书面记录，如沟通记录、解约协议等。这些记录可以作为未来处理任何潜在纠纷的依据。

3. 后续责任：在协商解约时，双方应明确后续的责任和义务。例如，如果解约后需要退还已支付的款项或交接相关物品，双方应明确具体的操作方式和时间节点。

综上所述，政府采购合同如果双方协商解约，需要遵循相关法律法规，并通过充分的沟通、达成一致意见、签订解约协议并执行等步骤来确保解约的合法性和有效性。同时，双方还应注意保留相关书面记录并明确后续责任和义务。