公司注销后签订的股东协议是不合法的。下面我将从法律角度为您详细解释这一结论：

法律依据与解释

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，公司经清算后注销的，法人消灭，因此原股东协议不再具有法律效力。股东协议的相关约定，应该在公司注销前履行完毕。具体来说：

1. 法人终止：依据《民法典》第六十八条，公司注销即意味着法人终止，法人终止后，其民事权利能力和民事行为能力均随之消灭，因此无法再签订或履行任何协议。

2. 清算期间法人地位：根据《民法典》第七十二条，清算期间法人虽然存续，但不得从事与清算无关的活动。这意味着，在清算期间及注销后，公司不能签订新的股东协议。

3. 债权债务终止：依据《民法典》第五百五十七条，公司注销后，其债权债务关系也随之终止。因此，注销后签订的股东协议无法产生法律效力，也无法作为债权债务的依据。

实际操作中的注意事项

1. 协议履行：如果公司在注销前已经签订了股东协议，且协议内容尚未履行完毕，那么应当在公司注销前尽快完成协议的履行，以避免因公司注销而导致的协议失效。

2. 法律后果：如果公司在注销后仍然签订了股东协议，那么这份协议将不具有法律效力，无法作为维权的依据。如果因此产生了纠纷，当事人将无法依据该协议主张权利。

综上所述，公司注销后签订的股东协议是不合法的，不具有法律效力。因此，建议公司在注销前妥善处理好所有未履行的股东协议，以避免不必要的法律纠纷。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。