针对您提出的“竞业协议当时签的两年，那企业的三成赔偿给两年吗”这一问题，首先我们需要明确竞业协议中的赔偿条款通常是如何约定的，以及这些条款与法律规定的关联。

结论前置：竞业协议中约定的赔偿期限和赔偿比例（如企业的三成赔偿）是双方协商的结果，并非固定不变。赔偿是否覆盖两年期限，需具体查看协议中的相关条款。若协议中明确约定了赔偿期限为两年，并且规定了赔偿比例为企业的三成，则企业应按此约定执行。若协议中未明确约定或约定不明，则需根据相关法律法规及双方协商来确定。

详细分析：

1. 协议条款的解读：

   • 竞业协议是双方自愿签订的法律文件，其中应明确约定竞业限制的期限、范围、方式以及违反竞业限制义务时应承担的违约责任，包括赔偿数额、赔偿方式等。
   • 如果协议中明确规定了赔偿期限为两年，并且详细说明了赔偿比例（如企业的三成），那么这一约定就是双方必须遵守的法律义务。

2. 法律规定的考量：

   • 根据《劳动合同法》等相关法律法规，竞业限制条款的设定应合理合法，不得损害劳动者的合法权益。
   • 如果竞业协议中的赔偿条款违反了法律法规的强制性规定，或者显失公平，那么这些条款可能被认定为无效。

3. 实际情况的灵活处理：

   • 在实际操作中，如果双方对赔偿期限和赔偿比例有争议，应首先尝试通过协商解决。
   • 如果协商不成，可以寻求法律援助或提起诉讼，由法院根据相关法律法规和协议内容作出裁决。

综上所述，竞业协议中约定的赔偿期限和赔偿比例是双方协商的结果，并非一成不变。在处理此类问题时，应首先查看协议中的具体条款，并结合相关法律法规进行综合分析。如果您对竞业协议中的赔偿条款有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。