加班迟到扣假通常不合法。具体分析如下：
关于加班无加班费：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，用人单位安排劳动者延长工作时间的，应当支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
- 因此，如果用人单位安排员工加班却不支付加班费，是违法的。
关于迟到扣假：
- 用人单位可以制定合理的规章制度对员工进行管理，若员工迟到确实违反了单位的规章制度，单位可以在合理范围内扣减工资，但扣减后的工资不得低于当地最低工资标准。
- 若单位因员工迟到短短几分钟（如1分钟）就采取扣除薪资或假期的制裁措施，这通常被视为过于严厉且可能触及法律红线。
- 除非用人单位拥有由法律法规认可、已经向全体雇员公开的管理规范，并明确规定了相关的惩戒措施以及具体的罚款或扣假标准，否则这样的做法是不合法的。
综上所述，加班迟到扣假通常不合法。如果员工遇到此类不合理情况，可以通过合法途径维护自身权益，例如向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。