法定节假日加班迟到扣钱是违法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法定节假日加班的法律规定
加班的强制性规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要延长工作时间的，必须与工会和劳动者协商一致，且一般每日不得超过一小时；特殊情况下延长工作时间每日不得超过三小时，每月累计不得超过三十六小时。这表明，用人单位不能单方面强制要求劳动者加班，更不能以扣钱等手段威胁劳动者加班。
法定节假日加班的特殊规定：
- 《中华人民共和国劳动法》第四十条明确规定了元旦、春节、国际劳动节、国庆节等法定休假日，用人单位应依法安排劳动者休假。同时，该法第四十四条进一步规定，法定休假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。这意味着，法定节假日加班必须支付高额加班费，且不能以调休等方式代替。
二、扣钱的违法性分析
扣钱的限制：
- 依据《工资支付暂行规定》第十五条，用人单位不得随意克扣劳动者工资，除非是在法律规定的特定情形下（如代扣代缴个人所得税、社会保险费用等）。因此，用人单位因劳动者拒绝法定节假日加班或加班迟到而扣钱是违法的。
劳动者权利：
- 劳动者在法定节假日有权拒绝加班，因为法律保障劳动者的休息权。用人单位不得以扣钱等手段威胁劳动者放弃休息。同时，如果劳动者同意在法定节假日加班，用人单位必须按照法律规定支付不低于工资的百分之三百的加班费。若未依法支付，劳动者有权要求其支付相应报酬。
三、维权途径
协商与投诉：
- 当遇到用人单位强制加班并扣钱的情况时，劳动者首先应与用人单位进行协商，要求其停止违法行为，支付加班费并返还克扣的工资。若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉举报，劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行查处。
申请仲裁与诉讼：
- 劳动者还可以选择向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过仲裁程序来维护自己的合法权益。对仲裁结果不服的，可以依法向人民法院提起诉讼。在仲裁和诉讼过程中，劳动者应提供充分的证据，如劳动合同、考勤记录、工资条等，以支持自己的主张。
四、特殊情况说明
- 如果劳动者在法定节假日加班时确实存在迟到等违反公司规章制度的行为，用人单位也不能直接扣钱。正确的做法是，用人单位应依据公司规章制度对劳动者进行相应的纪律处分，如警告、记过等，但不得克扣工资。如果用人单位的规章制度中明确规定了迟到等行为的处罚措施，且这些措施不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以按照规章制度执行。但任何处罚措施都不得与法律法规相抵触。
综上所述，法定节假日加班迟到扣钱是违法的。劳动者应了解自己的权益，勇于维权，并通过合法途径来解决问题。如果您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。