针对建筑工地副职办公用房超标的问题，处理方式需要遵循党政机关办公用房管理的相关规定，并确保整改过程合规、有效。以下是对此问题的详细解答：

一、超标办公用房的定义与认定

超标办公用房指的是办公用房的使用面积超过了规定的标准。具体的标准通常根据职级、岗位等因素来确定，并可能因地区、政策调整而有所变化。认定超标办公用房时，应遵循“以门为界”的原则，即如果分隔后的空间虽不通过一个房门进出，但实为领导干部专属使用，仍应计入个人办公用房使用面积之内。

二、整改方式

1. 以大调小：将超标的办公用房调换为面积较小的房间，以满足规定标准。
2. 合用办公：多个工作人员共用一间办公室，以减少个人占用面积。
3. 工程改造：在无法通过以上两种方式整改的情况下，可以考虑对办公用房进行工程改造，如拆除部分隔断、增加共享区域等，以有效利用空间并降低个人使用面积。

三、整改流程与注意事项

1. 制定整改方案：根据超标情况，结合实际情况制定可行的整改方案。
2. 实施整改：按照方案进行整改，确保整改过程不影响正常工作，并符合安全、消防等规定。
3. 验收与备案：整改完成后，由相关部门进行验收，并按照规定进行备案登记。如果因客观条件限制无法立即整改，应经相关主管部门审核批准后进行备案登记，并待条件成熟时一并整改。
4. 避免形式主义：整改过程中应坚持实事求是，反对形式主义和铺张浪费，确保整改效果真实有效。

四、违规处理与纪律要求

如果副职领导干部违规使用超标办公用房，并且不按照规定进行整改，可能会受到相应的纪律处分。如张家界市永定区住建局党组副书记、副局长陈杰因超标准配备使用办公用房并虚假整改而受到党内警告处分。因此，各级领导干部应严格遵守办公用房管理规定，带头发扬艰苦奋斗、勤俭节约的优良传统，自觉筑牢拒腐防变的作风“防火墙”。

综上所述，处理建筑工地副职办公用房超标的问题需要遵循相关规定和流程，确保整改过程合规、有效，并加强纪律监督，以维护良好的工作作风和办公环境。