工厂非法管控是一个严重的问题，它可能涉及到非法拘禁、侵犯员工权益等多种违法行为。针对这种情况，以下是一些建议的处理方式：

一、明确非法管控的行为

首先，要明确什么是非法管控。非法管控可能包括但不限于：非法限制员工人身自由、强制加班、剥夺员工休息权利、恶意克扣工资、非法搜查员工私人物品等行为。这些行为都严重侵犯了员工的合法权益，必须予以制止。

二、立即报警

如果员工发现自己或他人正在遭受非法管控，应立即向当地公安机关报警。报警时，要尽可能提供详细的证据和线索，如非法管控的具体时间、地点、参与人员、管控手段以及对受害者造成的身心伤害等。公安机关将会根据报案情况展开调查，并依法处理相关责任人。

三、寻求法律援助

在报警的同时，受害者也可以寻求法律援助。可以咨询专业的律师或法律援助机构，了解自己的合法权益和维权途径。律师将会为受害者提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助受害者维护自己的合法权益。

四、保留证据

在处理非法管控问题的过程中，保留证据至关重要。受害者应尽可能收集并保留与非法管控有关的证据，如聊天记录、视频录像、证人证言等。这些证据将有助于公安机关调查取证，也为后续的维权诉讼提供有力支持。

五、向相关部门投诉

除了报警和寻求法律援助外，受害者还可以向当地劳动监察部门、工会等相关部门投诉。这些部门将会对工厂的违法行为进行调查，并依法给予相应的处罚。同时，它们也会为受害者提供必要的帮助和支持。

六、加强员工权益保护意识

最后，要加强员工的权益保护意识。工厂应该加强对员工的法律教育和培训，让员工了解自己的合法权益和维权途径。同时，员工也应该积极维护自己的权益，敢于向违法行为说“不”。

综上所述，处理工厂非法管控问题需要多方面的努力和配合。受害者应立即报警、寻求法律援助、保留证据，并向相关部门投诉。同时，工厂也应该加强员工权益保护意识，确保员工的合法权益得到切实保障。