关于在职员工加班工资追溯时效的问题，这是一个涉及劳动者权益保护的重要议题。以下是对此问题的详细解答：
一、劳动仲裁时效
一般原则：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动争议申请仲裁的时效期间通常为一年。这一时效期间从当事人知道或应当知道自己的权利被侵害之日起计算。
特殊规定：
- 对于仍在用人单位工作的劳动者，或因拖欠劳动报酬（包括加班工资）与用人单位发生争议但尚未离职的劳动者，申请仲裁的时效不受上述一年限制。这意味着，只要劳动关系存续，劳动者可以随时就加班工资问题提起仲裁。
- 一旦劳动关系终止，劳动者就需在劳动关系终止之日起的一年内提出仲裁申请，以追讨在职期间被拖欠的加班工资。
时效中断与中止：
- 如果劳动者在时效期内向用人单位主张权利、向有关部门请求权利救济，或用人单位同意履行义务，仲裁时效将中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算一年。
- 在特定情况下，如因不可抗力或其他正当理由导致劳动者无法在规定的时效内申请仲裁，仲裁时效可以中止。待这些原因消失后，仲裁时效将继续计算。
二、诉讼时效
- 劳动纠纷需先经过劳动仲裁前置程序。若劳动者对仲裁结果不服，可向人民法院提起诉讼。此时，遵循《民法典》规定的诉讼时效，一般为三年。
- 诉讼时效的起算点是从仲裁裁决书送达之日起开始计算。劳动者在收到仲裁裁决书后，如对结果不满意，需要在三年内向法院起诉，否则可能会因超过诉讼时效而失去胜诉权。
三、操作建议
- 及时关注：劳动者应当及时关注自己的加班工资支付情况，确保权益不受侵害。
- 沟通协商：一旦发现问题，应首先与用人单位进行沟通协商，尝试通过和解的方式解决争议。
- 保留证据：在协商过程中，劳动者应保留好相关证据，如加班记录、工资单等，以支持自己的仲裁或诉讼请求。
- 启动法律程序：如果协商不成，劳动者应及时启动劳动仲裁等法律程序，确保在时效期内维护自己的权益。
综上所述，关于在职员工加班工资追溯时效的问题，劳动者应充分了解相关法律规定，并根据自己的实际情况选择合适的维权时机和方式。如有任何疑问或需要进一步的法律援助，建议咨询专业的法律人士以确保权益得到妥善保护。