建筑工程验收不合格，建设单位未经施工单位同意不能擅自拆除。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 建筑工程验收不合格的法律后果

1. 验收不合格的定义：根据相关法律法规，建筑工程验收不合格意味着该工程未达到规定的质量标准或存在安全隐患。
2. 法律后果：验收不合格的建筑工程，建设单位需要按照相关规定进行整改，直至达到合格标准。如果无法整改或整改后仍不合格，可能需要承担相应的法律责任，包括但不限于罚款、停工等。

二. 建设单位拆除工程的法律限制

1. 产权归属：即使工程验收不合格，其产权仍可能属于施工单位或相关权利人。建设单位在未经施工单位同意的情况下擅自拆除，可能侵犯了施工单位的财产权。
2. 法律规定：根据《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规，建设单位在拆除工程前，需要获得相关部门的批准，并遵循一定的程序。擅自拆除可能构成违法行为。

三. 解决建议

1. 协商处理：建设单位应与施工单位进行协商，共同确定不合格工程的处理方式。如果双方无法达成一致，可以通过法律途径解决争议。
2. 法律途径：如果协商无果，建设单位或施工单位可以依法向人民法院提起诉讼，由法院根据具体情况作出判决。

综上所述，建筑工程验收不合格时，建设单位不能未经施工单位同意就擅自拆除工程。这种做法不仅可能侵犯施工单位的财产权，还可能构成违法行为。我建议建设单位在面临此类问题时，应首先与施工单位进行协商，并遵循相关法律法规的规定进行处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。