针对“非法占用农用地罪被纪委监视居住怎么处理”的问题，首先明确的是，非法占用农用地罪属于刑事案件范畴，而纪委的监视居住通常与违纪或职务犯罪案件相关。这里涉及到两个不同性质的法律程序，但我可以为你提供一个全面的分析框架。

1. 关于非法占用农用地罪：

   • 如果你或你的亲友因非法占用农用地被立案侦查，并可能面临刑事责任，建议尽快寻求专业刑事辩护律师的帮助。
   • 律师可以协助你了解案件性质、法律后果，以及可能的辩护策略。
   • 在案件侦查、审查起诉和审判阶段，律师都可以为你提供法律支持，保护你的合法权益。

2. 关于纪委的监视居住：

   • 纪委的监视居住通常是对涉嫌违纪或职务犯罪的党员干部采取的一种强制措施。
   • 如果你被纪委采取监视居住措施，应积极配合调查，同时也有权了解自己的权利和义务。
   • 如果你认为自己的合法权益受到侵害，可以依法向有关部门反映或申诉。

3. 两者关系的处理：

   • 非法占用农用地罪与纪委的监视居住虽然性质不同，但可能存在一定的关联。例如，如果非法占用农用地行为涉及党员干部的违纪问题，纪委可能会介入调查。
   • 在这种情况下，建议你同时关注两个法律程序的发展，并咨询专业律师以获取全面的法律建议。
   • 律师可以帮助你协调两个程序之间的关系，确保你的合法权益得到最大程度的保护。

综上所述，如果你或你的亲友面临非法占用农用地罪和纪委监视居住的情况，建议尽快咨询专业律师以获取针对性的法律帮助。我可以为你提供详细的法律咨询和辩护策略，确保你的合法权益得到有效维护。