针对村里违反《农村土地承包法》的情况，纪委的处理方式通常遵循一系列严格的程序和规定。以下是对此问题的详细解答：

首先，需要明确的是，纪委作为党内监督机构，其主要职责是监督党的纪律执行情况，并对违反纪律的党员和党组织进行查处。当村里出现违反《农村土地承包法》的行为时，如果涉及党员或党组织，纪委将依据其职责和权限进行相应处理。

处理流程大致如下：

1. 接收举报或发现问题：

   • 纪委可能会通过群众举报、日常监督、专项检查等方式发现村里存在的违反《农村土地承包法》的行为。

2. 初步核实：

   • 纪委在收到举报或发现问题后，会进行初步核实，了解基本情况，判断是否存在违纪违法行为。

3. 立案审查：

   • 如果初步核实发现确实存在违纪违法行为，纪委将立案并进行深入审查。这包括收集证据、调查事实、询问当事人等。

4. 处理决定：

   • 根据审查结果，纪委将依据党的纪律和法律规定，对违纪违法人员作出处理决定。这可能包括谈话提醒、批评教育、责令检查、诫勉、组织处理或者党纪政务处分等。

5. 执行与监督：

   • 处理决定作出后，纪委将监督执行情况，确保处理决定得到落实。同时，纪委还会对类似问题进行持续监督，防止类似问题再次发生。

在具体处理过程中，纪委会充分考虑行为的性质、情节轻重以及造成的后果等因素，确保处理结果既符合党的纪律要求，又体现法律精神。此外，纪委还会与相关部门密切合作，共同维护农村土地承包制度的稳定性和权威性。

以江苏省淮安市清江浦区的案例为例，该区纪委监委通过清理不规范合同，严肃处理了违规土地承包合同问题，并对相关责任人给予了政务警告处分。这一案例充分展示了纪委在维护农村土地承包制度方面的积极作用和严肃态度。

综上所述，村里违反《农村土地承包法》时，纪委将依据其职责和权限进行严肃处理，以确保党的纪律和法律的严肃性和权威性得到维护。同时，纪委还会通过持续监督和制度建设等措施，推动农村土地承包制度的不断完善和发展。