周六周日休息扣绩效是否合法，需根据具体情况来判断。
首先，我们要明确绩效工资的扣减必须基于合法、合理且事先与劳动者有明确约定的前提。接下来，我从几个角度来分析这个问题：
合同约定：
- 如果劳动合同或公司的规章制度中明确规定了周六周日休息会扣减绩效，并且这一规定不违反法律法规的强制性规定，同时劳动者在入职时也已知晓并接受这一规定，那么在这种情况下扣减绩效是合法的。
- 但如果劳动合同或规章制度中没有相关规定，或者规定与法律法规相冲突，那么扣减绩效就是不合法的。
劳动法规定：
- 根据劳动法的规定，劳动者有权享受休息日。如果公司强行将休息日与绩效工资挂钩，试图通过扣减绩效来迫使劳动者在休息日工作，这很可能构成对劳动者休息权的侵犯，是不合法的。
合理性考量：
- 即便合同中有相关规定，扣减绩效也应当是合理且适度的。如果公司仅仅因为劳动者在休息日没有工作就大幅度扣减绩效，这显然是不合理的，也可能构成对劳动者的不公平对待。
综上所述，周六周日休息扣绩效是否合法，关键在于公司是否有合法、合理且事先与劳动者有明确约定的扣减依据。如果没有这样的依据，或者扣减行为违反了法律法规的强制性规定，那么扣减绩效就是不合法的。如果你在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。