旅馆业责令停产停业整顿的决定通常由具有行政处罚权的行政机关依法作出，具体决定部门取决于违法行为的性质和所属领域。一般来说，市场监督管理部门（含工商行政管理机关）、行业监管部门（如文化和旅游部门对于旅馆业的特定监管）、安全生产监督管理部门以及环境保护部门等都有可能在各自职责范围内对旅馆业作出责令停产停业整顿的决定。
市场监督管理部门：如果旅馆存在市场交易、广告宣传、商品质量、消费者权益保护等方面的严重违法行为，如虚假宣传、价格欺诈等，市场监督管理部门有权依据《中华人民共和国消费者权益保护法》等相关法律法规责令其停业整顿。
行业监管部门：旅馆业作为特定行业，受到文化和旅游部门等行业监管部门的监督管理。如果旅馆违反相关行业规定和法律法规，如未按照规定办理住宿登记、存在安全隐患等，行业监管部门有权责令其停产停业整顿。
安全生产监督管理部门：如果旅馆存在安全生产隐患，可能导致生产安全事故的情况，如消防设施不齐全、安全出口堵塞等，安全生产监督管理部门有权依据《中华人民共和国安全生产法》等相关法律法规责令其停产停业整顿。
环境保护部门：如果旅馆在经营过程中违反环境保护法律法规，造成严重环境污染或生态破坏，如排放污水、噪音扰民等，环境保护部门有权依据《中华人民共和国环境保护法》等相关法律法规责令其停产停业整顿。
因此，旅馆业在收到责令停产停业整顿的通知时，应首先明确是由哪个部门作出的决定，并了解具体的违法事实和法律依据。然后，应积极配合相关部门的调查和处理，及时进行整改，以确保符合法律法规要求，恢复正常营业。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。