协商解除协议后，在一定条件下仍然可以申请仲裁。具体分析如下：

1. 协议效力问题：

   • 如果协商解除协议存在欺诈、胁迫、重大误解等可撤销情形，或者协议内容违反法律法规的强制性规定，那么该协议可能被认定为无效或可撤销。在此情况下，劳动者可以申请仲裁，要求确认协议无效或撤销协议，并主张相应权利。

2. 未履行的权益问题：

   • 即使协商解除协议有效，但如果用人单位在协商过程中存在未依法支付经济补偿、拖欠工资、未缴纳社会保险等违反劳动法律法规的行为，劳动者可以就这些未履行的权益申请仲裁，要求用人单位予以支付或补缴。

3. 新发现的权益问题：

   • 如果在协商解除后，劳动者发现用人单位还有其他侵害其合法权益的行为，且该行为在协商解除时未涉及，劳动者也可以申请仲裁来维护自身权益。

4. 仲裁协议的独立性：

   • 值得注意的是，即使合同已经协商解除，但合同中的仲裁协议通常具有独立性。如果仲裁协议有效，双方仍然可以依据该仲裁协议就合同相关纠纷申请仲裁。

综上所述，协商解除后能否仲裁需根据具体情况判断，关键在于是否存在合法的仲裁事由。如果你在具体情况下遇到疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。