员工与店长发生矛盾不上班，用人单位应依据内部规章制度及国家相关法律法规进行处理。以下是对此问题的详细分析：

一. 了解矛盾情况与初步沟通

1. 了解矛盾原因：用人单位应首先了解员工与店长之间矛盾的具体原因和性质，这是解决问题的第一步。
2. 分别沟通：通过与涉事员工和店长分别沟通，听取双方陈述，以客观、公正的态度处理。对于因个人恩怨或误解导致的矛盾，可尝试进行调解。

二. 依据内部规章制度处理

1. 纪律处分：若员工未请假且无正当理由不上班，用人单位可根据内部规章制度，对其进行纪律处分，如警告、记过、扣除工资等。
2. 解除劳动合同：如员工旷工行为严重，达到规章制度规定的解除劳动合同条件，用人单位可依法解除劳动合同。

三. 遵守法律法规

1. 合法处理：在处理员工矛盾及旷工问题时，用人单位应严格遵守《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，确保处理程序合法、公正。
2. 员工权利：员工认为用人单位处理不当的，有权向劳动争议仲裁机构或人民法院提起诉讼，维护自身合法权益。

四. 建议的解决流程

1. 初步沟通：首先尝试通过沟通解决矛盾，促进双方和解。
2. 内部处理：若沟通无果，根据内部规章制度进行相应处理。
3. 法律途径：若员工或店长对处理结果不满，可通过劳动争议调解委员会申请调解，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，甚至通过诉讼途径解决。

五. 预防与后续措施

1. 预防机制：用人单位应建立有效的预防机制，如定期组织员工会议、座谈会等形式，听取员工的意见和建议，及时解决问题。
2. 良好工作环境：公司应制定明确的规章制度，公平地对待员工，避免任意扣减工资或不公正的处罚。此外，提供良好的工作环境和福利待遇也是关键。
3. 企业文化：建立良好的领导风格，倡导公平、诚信和尊重的企业文化，让员工感受到公正和关爱，从而促进员工与公司之间的和谐关系的建立和维护。

我的观点是，用人单位在处理员工与店长之间的矛盾及旷工问题时，应兼顾情、理、法，既要维护企业正常运营秩序，又要保障员工合法权益。同时，建立有效的预防机制和良好的工作环境对于减少此类纠纷至关重要。如有进一步需要，您可以继续咨询我。