针对您提出的“无资质的企业与有资质的企业共同投资承建双方签订的合伙协议是否有效”的问题，以下是我的详细分析：
结论前置：无资质的企业与有资质的企业共同投资承建所签订的合伙协议，其有效性需根据具体情况及法律法规综合判断。若合伙协议不存在法律规定的导致合同无效的情形，且合伙行为与建设工程施工并非同一法律关系，则合伙协议应认定为合法有效。
分析说明：
合伙协议的法律性质：
- 合伙协议是双方当事人真实意思表示，用于明确双方的权利义务关系，共同出资、共同经营、共负盈亏和风险。
- 合伙协议本身并不直接涉及建设工程施工的资质问题，而是关于双方如何合作进行投资承建的约定。
合同效力的判断依据：
- 根据《中华人民共和国合同法》（虽已废止，但相关规定在《民法典》中有所体现）及《民法典》的相关规定，合同效力的判断应依据合同是否存在无效情形，如欺诈、胁迫、恶意串通、损害国家、集体或第三人利益、违反法律、行政法规的强制性规定等。
- 若合伙协议不存在上述无效情形，则应认定为合法有效。
资质与合伙协议效力的关系：
- 虽然无资质的企业不能直接承接建设工程，但这并不影响其与有资质的企业签订合伙协议。
- 合伙协议的有效性并不直接取决于双方是否具备建设工程施工的资质，而是取决于协议内容是否合法、双方意思表示是否真实等因素。
司法实践中的处理：
- 在司法实践中，对于此类合伙协议的有效性，法院通常会根据具体情况进行审查。
- 若合伙协议内容合法、双方意思表示真实，且不存在其他无效情形，法院一般会认定协议有效。
实际操作建议：
- 在签订合伙协议前，双方应充分了解彼此的经营资质和实力，确保合作的合法性和可行性。
- 合伙协议中应明确约定双方的权利义务、出资方式、利润分配方式等关键条款，以确保合作的顺利进行。
- 如在合作过程中发生纠纷，应及时寻求法律途径解决，以维护双方的合法权益。
综上所述，无资质的企业与有资质的企业共同投资承建所签订的合伙协议，在不存在法律规定的无效情形且合伙行为与建设工程施工并非同一法律关系的情况下，应认定为合法有效。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。