公司性质不是合伙企业，签订的投资协议依然有效。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与协议有效性
合同效力的一般原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。这意味着，只要投资协议是双方真实意思的表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议就是有效的。
公司性质与协议效力的关系：
- 公司性质（如有限责任公司、股份有限公司等）与投资协议的效力没有直接关系。投资协议的有效性主要取决于协议内容是否合法、双方意思表示是否真实、是否存在欺诈、胁迫等情形。因此，即使公司不是合伙企业，只要投资协议符合上述条件，就是有效的。
不同情况下的协议效力分析
协议内容合法且双方意思表示真实：
- 如果投资协议的内容合法，且双方当事人在签订协议时均出于真实意思表示，没有受到欺诈、胁迫等不正当影响，那么该协议是有效的。无论公司性质如何，都不会影响协议的效力。
协议内容存在违法情形：
- 如果投资协议的内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者违背了公序良俗，那么该协议是无效的。这种情况下，公司性质不是合伙企业并不会成为协议有效的“保护伞”，协议依然会被认定为无效。
双方意思表示不真实：
- 如果一方当事人在签订投资协议时存在欺诈、胁迫等情形，导致另一方当事人的意思表示不真实，那么受欺诈或胁迫的一方有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该协议。撤销后，协议自始无效。
法律建议与风险提示
审查协议内容：
- 在签订投资协议前，务必仔细审查协议内容，确保协议条款合法、合规，且符合双方的真实意思表示。如有必要，可以请专业律师进行审查。
明确公司性质与投资方式：
- 虽然公司性质不是合伙企业不会影响投资协议的效力，但明确公司性质和投资方式有助于双方更好地了解各自的权利和义务。例如，如果是有限责任公司，股东的责任是有限的；如果是股份有限公司，股东的责任也是有限的，但公司的治理结构可能更为复杂。
保留相关证据：
- 在签订和履行投资协议过程中，务必保留好相关证据，如协议文本、转账记录、沟通记录等。这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用。
及时咨询专业律师：
- 如果在签订或履行投资协议过程中遇到任何法律问题或疑虑，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
总之，公司性质不是合伙企业并不会影响投资协议的效力。只要协议内容合法、双方意思表示真实，且不存在欺诈、胁迫等情形，那么该协议就是有效的。如有任何法律问题或疑虑，请随时向我咨询。