公司不能因员工不能胜任工作而拒绝其离职。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 员工离职的权利

1. 法律依据：根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。这是劳动者的基本权利，不受工作表现或其他非法定因素的影响。
2. 实际应用：即使员工不能胜任工作，他们仍然有权按照法律规定提出离职，并且公司应当尊重这一权利，不得无故拒绝。

二. 公司不能拒绝离职的情形

1. 不能胜任工作不是拒绝离职的理由：员工不能胜任工作，公司可以通过培训、调整岗位或解除劳动合同等方式处理，但不能以此为由拒绝员工的离职申请。
2. 离职申请的合法性：只要员工的离职申请符合《劳动合同法》的规定，公司就应当接受并办理相关手续。

三. 公司的应对措施

1. 协商处理：公司可以与员工协商，了解离职的具体原因，并尝试通过调整工作岗位、提供培训或其他激励措施来挽留员工。
2. 依法办理离职手续：如果员工坚持离职，公司应当依法为其办理离职手续，包括结算工资、出具离职证明等。

综上所述，公司不能因员工不能胜任工作而拒绝其离职。这是员工的法定权利，公司应当尊重并依法处理。如果公司拒绝办理离职手续，员工可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。我的观点是，公司应当与员工进行积极沟通，了解离职原因，并依法处理离职事宜，以维护双方的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。